由于三本院校学费高，又是民办性质，所以大多数考生在选档和投档录取中经常处于犹豫状态，多数考生出于无奈才选择三本院校，投档后退档的情况比较普遍，反复较大。山西省对三本院校的投档原则是：遵循志愿，保护高分。投档方式是：第一志愿依据志愿优先方式，参考志愿依据成绩优先方式。投档次序是：先投放考生第一志愿，若第一志愿投放完毕，在三本线上第一志愿的报考人数不足招生计划数，则投放参考志愿；若参考志愿投放完毕，仍然有不满额的院校，则面向社会公开征报考生志愿。
    对于面向社会征报的考生志愿，投档原则及方式与前面相同。投档次序是：先投放录取线上已征报的考生志愿，若线上征报的考生志愿投放完毕，还有不满额的院校，则根据统计的结果，降低适当的分数段投放考生档案。降分后投档次序为，先投放原报考生志愿，若仍有缺额院校，再投放征报考生志愿。这样不断地循环往复，直到所有院校投满为止。
     填报三本志愿时的注意事项
    （1）由于每年的高考录取线是动态变化的，分析同一院校不同年度的录取情况时，不能以各年度三本院校录取线的绝对值来比较，而只能以相应年度一本或二本线为参照值来比较。用一本、二本线作为参照值来比较，不用三本线为参照值，主要考虑到在录取线的划定过程中，三本线的划线比例不如二本线准确、稳定。以一本、二本线为参照值比三本线更能准确地反映真实情况。
    （2）由于各三本院校的办学条件、教学管理水平等差异较大、良莠不齐，考生千万不能以某个三本院校的院校名称来判断三本院校的优劣，一定要通过各种渠道，搜寻、掌握真实的院校信息，看它的校园环境、办学条件（教学楼、图书馆、实验室和学生宿舍）、师资力量，教学管理水平以及校风、学风等。必要的话可以通过实地考察，询问往年已录取的三本考生，了解掌握真实的院校信息，千万不能以院校所处地理位置或院校名称的名望高低来做出取舍。